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  1. SMILES & InChI | 化学结构的线性表示法 - 知乎

    Oct 16, 2019 · SMILES表示法、SMARTS表示法和InChI表示法都是用少量字符表示结构信息的重要方法。 化合物的图表示 可以将一个分子视为一个以原子为节点,结合为边的图。图形可以表示一个原子 …

  2. 机器学习做MD模拟时,分子的特征描述符指的是什么,和分子描述 …

    在上面这个示例里,我们将SMILES字符串“CCO”转化为一个长度为1024的位串(分子指纹),可以直接用作机器学习模型的输入特征。 简单总结一下: 分子的特征描述符是分子描述符在机器学习模型中 …

  3. 使用PubChem想搜索药物的SMILE只有药物名,能找到准确的化学结构 …

    SMILES的格式: PubChem提供的SMILES通常是标准的SMILES格式,可以直接用于其他化学软件或数据库。 如果您在PubChem上找不到您想要的药物SMILES,可以尝试以下方法: 使用其他化学信息 …

  4. 请问这种有机物表示方法叫什么名字啊? - 知乎

    这个是SMILES,要是想用这种分子描述方式来画结构式,给你提供一点思路。 1.直接复制进 chemdraw,自己会转化(相对的,手动操作,流程较长,不便于批量) 2.若要批量绘制,用 RDkit …

  5. 使用Python语言,smiles转化为2维分子图? - 知乎

    # 定义SMILES字符串 smiles = "CCO" # 这里以乙醇的SMILES为例,你可以替换成你需要的 # 根据SMILES创建分子对象 mol = Chem.MolFromSmiles (smiles) # 设置原子颜色,这里创建一个字典, …

  6. 求助网络药理学大神!? - 知乎

    Sep 18, 2020 · 药物成分: 1、中药单味药,复方(成分复杂,往往只做了提取部位的成分分离鉴别,大多数成分药理性质不清楚) 2、合成药物,天然药物分子(研究比较透彻) 成分靶点数据库Swiss …

  7. 有没有哪个软件可以查找各种物质的化学结构式? - 知乎

    PubChem 检索可得到的结果包含了分子式、SMILES、2D和3D结构、InChI和InChIKey、相对分子质量、脂水分配系数、氢键受体和供体数目、可旋转键数目、互变异构体数目等基本的结构信息和物化性 …

  8. 有没有化学或者药学的同学,smiles一致但pubchem号不同的两物质属 …

    Feb 28, 2022 · 有没有化学或者药学的同学,smiles一致但pubchem号不同的两物质属于一个物质吗? 正在做网络药理学,在数据库中搜到的成分,smiles一样,但是pubchem中属于两个物质,比 …

  9. 通过药物名称,怎样获取smiles号? - 知乎

    知乎,中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台,于 2011 年 1 月正式上线,以「让人们更好的分享知识、经验和见解,找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭借认真、专业、友善的社区 …

  10. 在线批量转化smile 到sdf: work smart - 知乎

    Jul 9, 2021 · 这个脚本本身或者经过简单的修改可快速在线将众多smiles转化为对应的三纬结构,而无需在自己电脑安装任何软件。 在Colab或者本地Jupyter(或者百度AI)运行该脚本,将smiles每行一个 …